Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CARMIL1Q5VZK9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
CARMIL1Q5VZK9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms