Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC33.79■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC33.79■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC33.78■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC33.77■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC33.77■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
C9orf84Q5VXU9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms