Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GARNL3Q5VVW2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GARNL3Q5VVW2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms