Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GKAP1Q5VSY0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms