Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRIP1Q5VSL9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms