Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RIF1Q5UIP0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIF1Q5UIP0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms