Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
C12orf60Q5U649 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C12orf60Q5U649 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms