Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SAMD5Q5TGI4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms