Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN11Q5T124 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN11Q5T124 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN11Q5T124 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN11Q5T124 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN11Q5T124 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN11Q5T124 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN11Q5T124 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN11Q5T124 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN11Q5T124 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN11Q5T124 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN11Q5T124 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN11Q5T124 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN11Q5T124 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN11Q5T124 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN11Q5T124 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN11Q5T124 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN11Q5T124 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN11Q5T124 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN11Q5T124 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN11Q5T124 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN11Q5T124 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN11Q5T124 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN11Q5T124 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UBXN11Q5T124 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UBXN11Q5T124 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN11Q5T124 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UBXN11Q5T124 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UBXN11Q5T124 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UBXN11Q5T124 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UBXN11Q5T124 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UBXN11Q5T124 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UBXN11Q5T124 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN11Q5T124 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms