Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGT7

RTP2, Receptor-transporting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP2Q5QGT7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP2Q5QGT7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP2Q5QGT7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP2Q5QGT7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP2Q5QGT7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP2Q5QGT7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP2Q5QGT7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP2Q5QGT7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP2Q5QGT7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP2Q5QGT7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP2Q5QGT7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP2Q5QGT7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP2Q5QGT7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP2Q5QGT7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP2Q5QGT7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP2Q5QGT7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP2Q5QGT7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP2Q5QGT7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP2Q5QGT7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP2Q5QGT7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP2Q5QGT7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP2Q5QGT7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP2Q5QGT7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP2Q5QGT7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP2Q5QGT7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP2Q5QGT7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP2Q5QGT7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP2Q5QGT7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms