Protein–RNA interactions for Protein: Q5M775

SPECC1, Cytospin-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1Q5M775 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SPECC1Q5M775 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms