Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COLEC12Q5KU26 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COLEC12Q5KU26 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms