Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMPD3Q5JV73 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FRMPD3Q5JV73 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms