Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A13Q5J8X5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A13Q5J8X5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms