Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XKR3Q5GH77 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms