Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms