Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT71Q3SY84 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms