Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SP6Q3SY56 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SP6Q3SY56 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms