Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LSM12Q3MHD2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms