Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
FHOD3Q2V2M9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
FHOD3Q2V2M9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
FHOD3Q2V2M9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
FHOD3Q2V2M9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
FHOD3Q2V2M9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
FHOD3Q2V2M9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
FHOD3Q2V2M9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
FHOD3Q2V2M9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
FHOD3Q2V2M9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
FHOD3Q2V2M9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
FHOD3Q2V2M9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.26
FHOD3Q2V2M9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
FHOD3Q2V2M9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC35.37■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
FHOD3Q2V2M9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC35.29■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC35.27■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
FHOD3Q2V2M9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
FHOD3Q2V2M9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
FHOD3Q2V2M9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
FHOD3Q2V2M9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
FHOD3Q2V2M9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
FHOD3Q2V2M9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
FHOD3Q2V2M9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms