Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM71Q2Q1W2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM71Q2Q1W2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms