Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SWI5Q1ZZU3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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