Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP1R3AQ16821 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1R3AQ16821 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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