Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA3Q16787 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms