Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
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