Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms