Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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