Protein–RNA interactions for Protein: Q15370

ELOB, Elongin-B, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOBQ15370 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELOBQ15370 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELOBQ15370 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELOBQ15370 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELOBQ15370 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELOBQ15370 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELOBQ15370 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELOBQ15370 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELOBQ15370 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELOBQ15370 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELOBQ15370 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELOBQ15370 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELOBQ15370 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ELOBQ15370 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELOBQ15370 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELOBQ15370 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELOBQ15370 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELOBQ15370 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELOBQ15370 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELOBQ15370 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELOBQ15370 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELOBQ15370 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELOBQ15370 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELOBQ15370 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELOBQ15370 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELOBQ15370 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELOBQ15370 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELOBQ15370 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELOBQ15370 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms