Protein–RNA interactions for Protein: Q15303

ERBB4, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB4Q15303 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERBB4Q15303 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ERBB4Q15303 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms