Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NFIXQ14938 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFIXQ14938 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms