Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC1AQ14683 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
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