Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMC2Q13753 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMC2Q13753 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMC2Q13753 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMC2Q13753 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMC2Q13753 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC2Q13753 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC2Q13753 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC2Q13753 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC2Q13753 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC2Q13753 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC2Q13753 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC2Q13753 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC2Q13753 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC2Q13753 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC2Q13753 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC2Q13753 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMC2Q13753 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMC2Q13753 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMC2Q13753 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMC2Q13753 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMC2Q13753 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMC2Q13753 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMC2Q13753 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMC2Q13753 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMC2Q13753 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMC2Q13753 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms