Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRR1Q13601 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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