Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XRCC4Q13426 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
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