Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLF1Q13351 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLF1Q13351 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLF1Q13351 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLF1Q13351 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLF1Q13351 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KLF1Q13351 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLF1Q13351 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLF1Q13351 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLF1Q13351 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLF1Q13351 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLF1Q13351 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLF1Q13351 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLF1Q13351 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLF1Q13351 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLF1Q13351 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLF1Q13351 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLF1Q13351 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLF1Q13351 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLF1Q13351 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLF1Q13351 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLF1Q13351 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLF1Q13351 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLF1Q13351 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLF1Q13351 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLF1Q13351 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLF1Q13351 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLF1Q13351 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLF1Q13351 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLF1Q13351 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLF1Q13351 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLF1Q13351 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLF1Q13351 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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