Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP4Q13115 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
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