Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF1Q13077 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
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