Protein–RNA interactions for Protein: Q12999

TSPAN31, Tetraspanin-31, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN31Q12999 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms