Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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FOXC1Q12948 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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FOXC1Q12948 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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