Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TROQ12816 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TROQ12816 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
TROQ12816 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TROQ12816 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TROQ12816 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TROQ12816 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TROQ12816 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TROQ12816 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TROQ12816 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TROQ12816 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TROQ12816 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TROQ12816 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TROQ12816 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TROQ12816 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TROQ12816 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TROQ12816 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TROQ12816 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TROQ12816 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TROQ12816 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TROQ12816 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TROQ12816 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TROQ12816 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TROQ12816 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TROQ12816 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TROQ12816 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TROQ12816 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TROQ12816 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TROQ12816 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TROQ12816 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TROQ12816 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TROQ12816 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TROQ12816 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
TROQ12816 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TROQ12816 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TROQ12816 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TROQ12816 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TROQ12816 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TROQ12816 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TROQ12816 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TROQ12816 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TROQ12816 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TROQ12816 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TROQ12816 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TROQ12816 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TROQ12816 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TROQ12816 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TROQ12816 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TROQ12816 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TROQ12816 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TROQ12816 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TROQ12816 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TROQ12816 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TROQ12816 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TROQ12816 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TROQ12816 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TROQ12816 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
TROQ12816 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TROQ12816 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TROQ12816 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TROQ12816 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TROQ12816 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
TROQ12816 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TROQ12816 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TROQ12816 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TROQ12816 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TROQ12816 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TROQ12816 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TROQ12816 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TROQ12816 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TROQ12816 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TROQ12816 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TROQ12816 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TROQ12816 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TROQ12816 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TROQ12816 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
TROQ12816 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TROQ12816 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TROQ12816 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TROQ12816 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TROQ12816 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
TROQ12816 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TROQ12816 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TROQ12816 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TROQ12816 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
TROQ12816 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TROQ12816 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TROQ12816 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TROQ12816 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TROQ12816 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TROQ12816 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TROQ12816 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TROQ12816 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TROQ12816 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TROQ12816 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TROQ12816 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TROQ12816 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TROQ12816 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TROQ12816 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TROQ12816 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
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