Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms