Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGM3Q08188 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms