Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EGR3Q06889 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EGR3Q06889 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EGR3Q06889 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EGR3Q06889 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EGR3Q06889 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EGR3Q06889 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EGR3Q06889 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EGR3Q06889 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms