Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPB1Q06547 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABPB1Q06547 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms