Protein–RNA interactions for Protein: Q06149

PDR8, Transcription factor PDR8, yeastyeast

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR8Q06149 TMN2YDR107C 2019 nt4.49□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 MPS3YJL019W 2049 nt4.49□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 ARG4YHR018C 1392 nt4.49□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 SKM1YOL113W 1968 nt4.49□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 GMC1YDR506C 1827 nt4.49□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 HOM3YER052C 1584 nt4.48□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt4.48□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt4.48□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 YPL260WYPL260W 1656 nt4.48□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 BUD7YOR299W 2241 nt4.48□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 LHP1YDL051W 828 nt4.48□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 MSS2YDL107W 1056 nt4.48□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt4.48□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 MRPS35YGR165W 1038 nt4.48□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 LNP1YHR192W 837 nt4.48□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 APS1YLR170C 471 nt4.48□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 YBL094CYBL094C 333 nt4.48□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 OSW1YOR255W 837 nt4.48□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 SUT2YPR009W 807 nt4.48□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 YBR292CYBR292C 372 nt4.48□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 AVT1YJR001W 1809 nt4.48□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 SSA2YLL024C 1920 nt4.48□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 YMR1YJR110W 2067 nt4.47□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 TIF4632YGL049C 2745 nt4.47□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 SSB1YDL229W 1842 nt4.47□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 SSB2YNL209W 1842 nt4.47□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 DAM1YGR113W 1032 nt4.47□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 YHR054CYHR054C 1065 nt4.47□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 HOT13YKL084W 351 nt4.47□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 YLR042CYLR042C 486 nt4.47□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 YLR125WYLR125W 411 nt4.47□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 ORM2YLR350W 651 nt4.47□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 YMR010WYMR010W 1218 nt4.47□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 PRM4YPL156C 855 nt4.47□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 PRP28YDR243C 1767 nt4.47□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 KCC4YCL024W 3114 nt4.47□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 SYP1YCR030C 2613 nt4.46□□□□□ -1.69
PDR8Q06149 RAD30YDR419W 1899 nt4.46□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 FBP26YJL155C 1359 nt4.46□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 YCR100CYCR100C 951 nt4.46□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 YDL027CYDL027C 1263 nt4.46□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 SPR28YDR218C 1272 nt4.46□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 YER085CYER085C 522 nt4.46□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 LYS5YGL154C 819 nt4.46□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 ERG25YGR060W 930 nt4.46□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt4.46□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 YKL023WYKL023W 834 nt4.46□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt4.46□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 CUS2YNL286W 858 nt4.46□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 MED7YOL135C 669 nt4.46□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 CSH1YBR161W 1131 nt4.46□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 Q0255Q0255 1419 nt4.46□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 STR2YJR130C 1920 nt4.45□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt4.45□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 YDL186WYDL186W 834 nt4.45□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 POL32YJR043C 1053 nt4.45□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 YAL066WYAL066W 309 nt4.45□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt4.45□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 YLR462WYLR462W 609 nt4.45□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt4.45□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 YIF1YNL263C 945 nt4.45□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 AIF1YNR074C 1137 nt4.45□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 YOL118CYOL118C 309 nt4.45□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 MGR2YPL098C 342 nt4.45□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 YCL012CYCL012C 405 nt4.45□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 MNN1YER001W 2289 nt4.45□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 GAS5YOL030W 1455 nt4.44□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 PRM1YNL279W 1986 nt4.44□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 RPL43BYJR094W-A 279 nt4.44□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 MTD1YKR080W 963 nt4.44□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 NSE1YLR007W 1011 nt4.44□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt4.44□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 POP8YBL018C 402 nt4.44□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 RCE1YMR274C 948 nt4.44□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 MDJ2YNL328C 441 nt4.44□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 TAF3YPL011C 1062 nt4.44□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 MUM2YBR057C 1101 nt4.44□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 HSP82YPL240C 2130 nt4.44□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 YPR142CYPR142C 564 nt4.44□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 CDC48YDL126C 2508 nt4.44□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 GGA1YDR358W 1674 nt4.44□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 RIM21YNL294C 1602 nt4.43□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 HSE1YHL002W 1359 nt4.43□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 TYR1YBR166C 1359 nt4.43□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 OAF1YAL051W 3144 nt4.43□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 SWI3YJL176C 2478 nt4.43□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 SUP35YDR172W 2058 nt4.43□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt4.43□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 BMH1YER177W 804 nt4.43□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 SUT1YGL162W 900 nt4.43□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 YBL062WYBL062W 381 nt4.43□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 AIM39YOL053W 1188 nt4.43□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 SET6YPL165C 1122 nt4.43□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt4.43□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt4.43□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 APA1YCL050C 966 nt4.43□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 CAB3YKL088W 1716 nt4.43□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 FRS1YLR060W 1788 nt4.42□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 APC4YDR118W 1959 nt4.42□□□□□ -1.7
PDR8Q06149 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt4.42□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.6 ms