Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CTDSPL2Q05D32 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms