Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNP2Q05952 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNP2Q05952 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNP2Q05952 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNP2Q05952 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNP2Q05952 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNP2Q05952 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TNP2Q05952 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TNP2Q05952 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
TNP2Q05952 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TNP2Q05952 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TNP2Q05952 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
TNP2Q05952 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNP2Q05952 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms