Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 NRK1YNL129W 723 nt3.15□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 POP3YNL282W 588 nt3.15□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 IDI1YPL117C 867 nt3.15□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 PMT4YJR143C 2289 nt3.15□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 TCO89YPL180W 2400 nt3.15□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 FAR8YMR029C 1572 nt3.15□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 GSH2YOL049W 1476 nt3.15□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 KRE29YER038C 1395 nt3.14□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 LAP2YNL045W 2016 nt3.14□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 PDR12YPL058C 4536 nt3.14□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 EAF5YEL018W 840 nt3.14□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 BUD16YEL029C 939 nt3.14□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 REC104YHR157W 549 nt3.14□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 RPB3YIL021W 957 nt3.14□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 EOS1YNL080C 1101 nt3.14□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 ARO80YDR421W 2853 nt3.14□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 TYW1YPL207W 2433 nt3.14□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 TIP20YGL145W 2106 nt3.14□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 RSC3YDR303C 2658 nt3.14□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 MCM7YBR202W 2538 nt3.14□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 ELM1YKL048C 1923 nt3.13□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 IRC22YEL001C 678 nt3.13□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 YER076CYER076C 909 nt3.13□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 LNP1YHR192W 837 nt3.13□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 AAD10YJR155W 867 nt3.13□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 MRPL20YKR085C 588 nt3.13□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt3.13□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 SNF8YPL002C 702 nt3.13□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 AVT7YIL088C 1473 nt3.13□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 SMF1YOL122C 1728 nt3.13□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 ROD1YOR018W 2514 nt3.12□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 YDR445CYDR445C 408 nt3.12□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 UTP11YKL099C 753 nt3.12□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 YPT53YNL093W 663 nt3.12□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 OCA1YNL099C 717 nt3.12□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 SAS10YDL153C 1833 nt3.12□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 GRS2YPR081C 1857 nt3.11□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 YDR230WYDR230W 348 nt3.11□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 COS4YFL062W 1140 nt3.11□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 FMP48YGR052W 1110 nt3.11□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 GVP36YIL041W 981 nt3.11□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 SPC34YKR037C 888 nt3.11□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 COS3YML132W 1140 nt3.11□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 RPL19AYBR084C-A 570 nt3.11□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 COS2YBR302C 1140 nt3.11□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 YER077CYER077C 2067 nt3.11□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 YOL075CYOL075C 3885 nt3.11□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 FAD1YDL045C 921 nt3.1□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 RPS13YDR064W 456 nt3.1□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 YGL088WYGL088W 366 nt3.1□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt3.1□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 NIS1YNL078W 1224 nt3.1□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 RET3YPL010W 570 nt3.1□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 TIP41YPR040W 1071 nt3.1□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 NTH1YDR001C 2256 nt3.1□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 EKI1YDR147W 1605 nt3.1□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 LOS1YKL205W 3303 nt3.1□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 FAT1YBR041W 2010 nt3.1□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 KIN4YOR233W 2403 nt3.1□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 TRK1YJL129C 3708 nt3.09□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 PRP19YLL036C 1512 nt3.09□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 UBC1YDR177W 648 nt3.09□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 AIR1YIL079C 1083 nt3.09□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 YIL163CYIL163C 354 nt3.09□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 SRP40YKR092C 1221 nt3.09□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 TAF11YML015C 1041 nt3.09□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 BCK2YER167W 2556 nt3.09□□□□□ -1.91
YHP1Q04116 GWT1YJL091C 1473 nt3.09□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 HMG1YML075C 3165 nt3.08□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 TAF7YMR227C 1773 nt3.08□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 GLN4YOR168W 2430 nt3.08□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 SPT6YGR116W 4356 nt3.08□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 RAM1YDL090C 1296 nt3.08□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 AHA1YDR214W 1053 nt3.08□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 YGR011WYGR011W 327 nt3.08□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 CDC12YHR107C 1224 nt3.08□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 NSE1YLR007W 1011 nt3.08□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 SWC7YLR385C 399 nt3.08□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt3.08□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 SPT23YKL020C 3249 nt3.08□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 YBR225WYBR225W 2703 nt3.08□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 NTA1YJR062C 1374 nt3.08□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 YTM1YOR272W 1383 nt3.08□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 MMR1YLR190W 1476 nt3.08□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 GAS5YOL030W 1455 nt3.08□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 OSH2YDL019C 3852 nt3.08□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 NUP159YIL115C 4383 nt3.07□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 USA1YML029W 2517 nt3.07□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 HOM2YDR158W 1098 nt3.07□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 YGL074CYGL074C 327 nt3.07□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt3.07□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 ADD66YKL206C 804 nt3.07□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 PFA4YOL003C 1137 nt3.07□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 REX4YOL080C 870 nt3.07□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 YBR219CYBR219C 384 nt3.07□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 GCN5YGR252W 1320 nt3.07□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 CLB4YLR210W 1383 nt3.07□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 UBP6YFR010W 1500 nt3.07□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 RDH54YBR073W 2877 nt3.06□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 SNM1YDR478W 597 nt3.06□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 147.9 ms