Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SPIBQ01892 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms