Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CDKL1Q00532 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms